病害的监测在农业中占有重要地位，在早期发现病害引起作物生理上的变化，就能进行预防治疗，减小其对产量的影响。通常可将作物病害分为侵染性病害与非侵染性病害。非侵染性病害通常由环境因素导致，如水分胁迫。侵染性病害则是由病原生物侵染宿主所引起的病害。对于侵染性病害，在传统目测监测方法中，如能观察到叶表发生的变化，则此时大多数作物病害已处于较严重的时期。

在病毒监测中，红外热成像仪可获取病毒感染部位的温度随时间变化情况，将其与可见光图片作对比，可验证将红外热成像技术应用于早期检测中的可行性。用热像仪监测黄瓜叶片以研究黄瓜霜霉病的早期检测。将黄瓜霜霉病毒病变过程分成4个时期，其中热像仪在第1期发现其温度低于正常温度。受到病毒侵染后的部位气孔产生了生理变化，进行过度的蒸腾作用而导致叶温比正常值更低。而肉眼看见叶面出现变化时病变已经发展到了第3期或第4期。用热像仪监测模拟黄瓜叶片受镰刀真菌感染部位的温度变化。用浓度为100mg/L镰刀菌酸滴液处理黄瓜叶片，并与另一个用纯水处理的黄瓜叶片作比较。叶片处理的部位在4h后出现热效应，较纯水处理组高0.9℃，并在之后温度持续上升，在9h后叶片出现了肉眼可见的病斑特征，此时高出约3.8℃，差异性达到显著水平。用热像仪监测感染了烟草花叶病毒的烟草叶的温度变化。在感染后的7～9h出现热效应，感染部位较周围的部位高0.3～0.4℃，比肉眼观察法提前31h观察到感染特征。用热像仪监测感染了小麦条锈病的小麦。在接种病毒后的第六天通过热红外图像观测到了条锈病病斑，较可见光图片提早了四天观测到病变特征。

热成像仪在病毒早期监测中具有良好的效果，为基于机器视觉的病毒早期监测提供了较可见光监测更具有时效性的监测手段。